需要注意的是，在工程造價的直接費中的材料費，是指該項建筑工程所使用的所有材料，不管這些材料是施工方購買的，還是由建設方即甲方直接提供的。這可以從住房和城鄉建設部頒布的《建設工程工程量清單計價規范》的解釋中得到印證。該解釋規定，甲方供料應計入投標報價中，并在綜合單價中體現；甲方購買材料費必須列入綜合單價，如果在招投標階段無法準確定價，應按暫估價。
從上面的工程造價圖可以看出，施工方因“甲供材”所需繳納的相關稅金，實際上是包含在工程造價中的。也就是說，雖然“甲供材”涉及營業稅的名義納稅人是施工方，但實際負稅人卻是建設方。
然而，實際情況并非如此。上文提到，建設方愿意自己購買材料，除了有控制工程質量的考慮外，還有一個目的就是降低工程的造價。比如，實踐中經常會碰到建設方和施工方在確定工程造價時，明確約定“甲供材”不參與計提管理費和利潤。甚至在某些情況下，建設方約定“甲供材”也不參與提稅，即工程最終決算造價中不包含“甲供材”稅金，從而導致施工方為降低自身稅收負擔而逃避納稅。
“甲供材”財務核算方法
在實踐中，“甲供材”的財務核算主要有兩種方法：
方法一：“甲供材”直接計入投資賬戶。建設方在領發“甲供材”時，按材料實際購買價，借記“在建工程——××工程”，貸記“工程物資”。而施工方在收到材料及以后發出材料時不作賬務處理，只在賬外登記管理，“甲供材”部分不反映在施工方的工程收入和工程支出中。
方法二：“甲供材”通過轉賬結算。建設方在“甲供材”發出時，直接按材料的預算價抵作預付給施工方的工程款。材料發出時，借記“預付賬款”（或預付工程款），貸記“工程物資”（或庫存材料）。由于沖抵的預付賬款（或預付工程款）是按材料預算價，而轉出的工程物資是按實際購買價，之間存在的差額直接計入工程成本，視其差額的正負情況，借（或貸）記“在建工程——××工程”。而施工方一般都是在收到材料時按材料的預算價，借記“庫存材料”，貸記“預收賬款”。
上述兩種不同的財務核算方式，在實務中對應了兩種“甲供材”的稅收管理模式。
模式一：只繳稅，不開票。
在方法一中，由于建設方在材料發出時，直接計入了在建工程的成本。因此，在最終結算的環節，施工方對于“甲供材”部分只繳稅，不開票，否則就會導致“甲供材”重復計入成本。
模式二：既繳稅，又開票。
在方法二中，由于建設方發出材料時，按材料預算價作為預付賬款，未入工程成本，只是按預算價與實際購買價格之間的差額直接進入了工程成本。此時，施工方需要按“甲供材”的實際購買價繳納營業稅，但只能按預算價開具建筑業發票。
兩種核算方法的優劣分析
方法一的劣勢：建設方在材料發出時直接計入工程成本，但實際上材料還沒有用于或全部用于工程，將會導致會計信息失真。同時，施工方在收到材料和發出材料時，均不進行任何會計處理，不利于建設工程在實施過程中對“甲供材”的使用和監督管理。
對應方法一的稅務管理模式，首先，由于建設方發出材料時直接按材料成本計入工程成本，無需憑工程發票計入成本，在一定程度上強化了建設方不愿意將“甲供材”稅金提給施工方的動機。建筑工程雙方的矛盾，在一定程度上加大了稅務機關的管理難度。其次，由于施工方對于“甲供材”只繳稅、不開票，稅務機關在對“甲供材”進行管理時必須主動出擊，嚴格按照國家稅務總局《關于印發不動產、建筑業營業稅項目管理及發票使用管理暫行辦法的通知》（國稅發〔2006〕128號）的要求，做好每一個建筑業營業稅的項目登記工作，特別是項目清算環節的稅收管理。再其次，由于施工方“甲供材”本身需要繳納營業稅，因此，建設方在實踐中有時會和施工方串通，將“甲供材”金額在繳稅同時開入建筑業發票中，重復計入成本。
方法一的優勢：方法一的優勢主要對應的就是方法二的劣勢。因此，我們需要先來看方法二的劣勢。在方法二中，由于施工方需要按“甲供材”的預算價開具發票，在會計上，這部分金額，施工方必須作為收入處理。但對應這部分的收入，施工方無法取得對應的材料成本憑證入賬。因為材料是甲方直接購買的，相關發票的抬頭是建設方。而這一問題在方法一中卻不存在，施工方對于“甲供材”只繳稅、不開票。
方法二的劣勢：實務中，部分稅務機關根據工程預算造價單中“甲供材”的預算價，以及通過審核建設方、施工方關于“甲供材”的購買發票、出庫單、入庫單和領料單來認可施工方對應的“甲供材”成本。但是，這一做法難以得到廣泛的認可。特別是在建筑工程跨地區施工情形下，工程所在地稅務機關的做法并不一定能得到施工企業主管稅務機關的認可。
方法二的優勢：方法二最大的優勢在于稅務管理上。由于建設方材料發出時沒有計入工程成本，最終只能憑建筑業發票計入成本。因此，建設方需要建筑業發票計入成本的動機客觀上有助于稅務機關對于“甲供材”的稅收管理。稅務機關就可以變主動出擊為被動防御，即通過禁止建設單位直接憑材料購買發票計入成本的行為，再配合建筑業相關登記的管理手段，就可以實現比較高效的“甲供材”稅收管理。但是，稅務機關需要注意的是，在方法二中，施工單位按“甲供材”開票時，也只能按預算價而不是其實際購買價（即營業稅計稅依據）開票。
“甲供材”營業稅納稅義務發生時間
對于“甲供材”的營業稅納稅義務發生時間，目前并無明確規定。根據《營業稅暫行條例》相關規定，建筑業是按預收款確定營業稅納稅義務發生時間，如果將建設方把“甲供材”提供給施工方視作建設方以材料方式預付款的話，施工方取得“甲供材”時，就應該繳納營業稅。但是在實踐中，施工方無法取得“甲供材”的實際購買價。同時，在工程決算環節，涉及多提供材料或少提供材料時，雙方還需要重新計算相應的金額。因此，“甲供材”在工程最終決算環節一次性繳納營業稅比較合理，也便于稅務管理。
