二、項目登記范圍
12號文件規(guī)定：“各級地方稅務(wù)機(jī)關(guān)對納稅人承攬的建筑業(yè)工程實行項目登記管理，并根據(jù)下列情況分別進(jìn)行一般登記和簡易登記。”而244號文件規(guī)定：“本省范圍內(nèi)規(guī)模以上（具體規(guī)模標(biāo)準(zhǔn)由各地自行確定）建筑工程項目與施工企業(yè)承接的異地建筑工程項目均應(yīng)進(jìn)行項目登記。”較之于244號文件，12號文件要求所有的項目均要辦理登記，即一個項目一個登記。
三、項目登記要求
12號文件規(guī)定：“納稅人應(yīng)在建筑工程合同簽訂之日起30日內(nèi)向項目所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理項目登記。”而244號文件規(guī)定：“建筑工程項目的登記對象為工程建設(shè)方與施工方，即采集建筑業(yè)雙向的信息。”較之于244號文件，12號文件將雙向登記改為了單向登記，更加方便基層開展工作。
四、總分包工程的登記要求
12號文件規(guī)定：“納稅人在本身范圍內(nèi)承攬涉及總分包的工程項目，應(yīng)進(jìn)行一般登記。”而244號文件規(guī)定：“建筑工程項目實行分包或轉(zhuǎn)包的，由總包方統(tǒng)一向稅務(wù)機(jī)關(guān)提供項目信息，分包方與轉(zhuǎn)包方不需再提供項目信息。”較之于244號文件中基于扣繳模式下的總包登記，12號文件是基于差額抵扣模式下的各自登記，將更加有利于稅務(wù)機(jī)關(guān)對施工方的管理。
五、水、電、氣供應(yīng)單位項目登記要求
12號文件規(guī)定：“水、電、氣供應(yīng)單位、廣播電視系統(tǒng)、電信單位從事的管道安裝工程、初裝工程、電信工程等項目金額較小、開票較頻繁的零星建筑工程，可不進(jìn)行簡易項目登記。但符合一般登記條件的建筑項目，必須納入項目管理。”而244號文件中，對此無任何規(guī)定，12號文件的此項規(guī)定，進(jìn)一步補(bǔ)充完善了項目登記的范圍規(guī)定。
六、異地項目工程管理要求
12號文件規(guī)定：“對納稅人承攬本省范圍內(nèi)的異地建筑業(yè)勞務(wù)，機(jī)構(gòu)所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)與項目所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)加強(qiáng)協(xié)調(diào)配合，建立聯(lián)系制度，依托信息化手段，確保信息渠道暢通。”而244號文件規(guī)定：“納稅人提供異地建筑業(yè)應(yīng)稅勞務(wù)的，應(yīng)同時按照上述規(guī)定向機(jī)構(gòu)所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)進(jìn)行異地建筑工程項目登記。”較之于244號文件，12號文件取消異地建筑工程項目登記的要求。
七、自開票認(rèn)定管理機(jī)構(gòu)
12號文件規(guī)定：“符合第十二條第（一）款規(guī)定條件的建筑業(yè)納稅人可向項目所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)提出自開票納稅人資格認(rèn)定申請。”而244號文件規(guī)定：“自開票納稅人，是指符合規(guī)定條件，向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申請領(lǐng)購并自行開具建筑業(yè)發(fā)票的單位。”較之于244號文件，12號文件中，負(fù)責(zé)審批的主管單位由主管稅務(wù)機(jī)關(guān)變?yōu)榱隧椖克诘刂鞴芏悇?wù)機(jī)關(guān)。
八、發(fā)票開具內(nèi)容
12號文件規(guī)定：“下列情形所涉金額不得在建筑業(yè)發(fā)票上開具：（一）建設(shè)單位提供的材料和設(shè)備價款；（二）提供建筑業(yè)勞務(wù)的同時銷售自產(chǎn)貨物的銷售額；（三）省級以上稅務(wù)機(jī)關(guān)規(guī)定的其他情形。”而244號文件對此無明確要求。12號文件中，該項內(nèi)容的增加，不僅是與新營業(yè)稅暫行條例的呼應(yīng)，也將更加有利于規(guī)范甲供材的管理。
九、預(yù)清算發(fā)起要求
12號文件規(guī)定：“進(jìn)行一般登記的建筑業(yè)項目，符合下列條件之一的，應(yīng)按本辦法規(guī)定向項目所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理項目預(yù)清算：（一）外來施工方承攬本地的建筑業(yè)項目；（二）本地納稅人承攬本地建筑業(yè)項目，且合同金額在1000萬元以上的；（三）項目所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)認(rèn)為需要預(yù)清算的。”較之于244號文件，12號文件增加了預(yù)清算的內(nèi)容，能更好的實現(xiàn)對外來施工方和本地大額建筑工程稅款征繳的掌控。
十、最終清算的要求
12號文件規(guī)定：“進(jìn)行一般登記的建筑業(yè)項目，具有下列情形之一時，應(yīng)進(jìn)行項目最終清算：（一）工程項目的營業(yè)稅納稅義務(wù)已完全發(fā)生；（二）合同終止或解除的；（三）申請辦理項目注銷登記的；（四）納稅人申請注銷稅務(wù)登記但未辦理建筑業(yè)項目清算手續(xù)的；（五）項目所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)規(guī)定的其他情形。”而244號文件規(guī)定：“施工方在建筑業(yè)工程項目完工并經(jīng)相關(guān)部門竣工驗收及出具工程竣工結(jié)算報告之日起30日內(nèi)，向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申請建筑工程項目清算。”較之于244號文件，12號文件更加細(xì)化了最終清算的條件，而不僅僅是以是否出具工程竣工結(jié)算報告為條件，將更加有利于主管稅務(wù)機(jī)關(guān)對于清算面的掌控。
